全县分为七区，七区之中包括四厢十二堡。
七区是:
城区:分东西南北四厢，为全县政治中心。
仁丰区[7]:即篁乡堡。公平圩、菖蒲圩(即篁乡圩)为本区两个政治中心，各设一个局。
双桥区:即双桥堡。内分十三段，以留车为政治中心。
南八区:分南桥、八富两堡，以牛斗光为政治中心。
兼三区:分项山、腰古、滋溪三堡，以吉潭为政治中心。
澄江区:分寻乌、大墩、桂岭三堡，以澄江圩为政治中心。
三水区:分三标、水源两堡，以三标圩为政治中心。
明万历前寻乌还未设县，万历以后才设县。没有设县的时候，一部分属江西的安远县管辖，设置石溪堡，其地域是现在的澄江、三水、仁丰、县城等区；一部分属广东平远县管辖，其地域是现在的双桥、南八、兼三等区。